长江流域湖泊众多，是弥足珍贵的自然资源，也是十分脆弱的生态系统。近年来，长江流域湖泊面积萎缩和水质恶化情况堪忧。以湖北省为例，该省295个重点湖泊水质符合Ⅱ~Ⅲ类的仅占10.7%。
在全国政协委员、澳门赌场院士王焰新看来，当前湖泊治理的难点、痛点问题主要体现在以下四个方面。
一是在理念层面绿色发展意识逐级递减。二是在治理层面综合统筹乏力。三是在经济层面专项资金短缺。四是在科技层面存在难点，如湖泊磷污染源控制不力等。
为此，他建议，进一步做好长江大保护的顶层设计，统筹建立“空、天、地表、地下（水下）”立体监测体系，建设长江生态大数据中心，实现长江中游流域生态环境要素的全息监测和智慧管理，作为流域生态环境问题的诊断依据。同时，构建以生态修复为核心竞争力的绿色产业体系，大力发展生态环境监测、节能环保、清洁能源、生态环境和绿色服务产业，不断拓展绿色产业的“新蓝海”。此外，建立农药化肥减量增效激励机制，重点支持农业科研单位研发新型高效肥料与农药，补贴农业生产引入机械施肥、种肥同播等提高化肥利用效率技术。
“长江大保护必须依靠科技创新。”王焰新建议筹建“长江水科学”国家实验室，为长江大保护提供科技支撑。
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